Глубокое обучение поможет создавать белки с новыми функциями

❤ 71 , Категория: Новости,   ⚑ 12 Окт 2021г,     ☻ 0

Новый алгоритм превзошел существующие алгоритмы по точности предсказания функции белка на основании его последовательности. Эффективность подхода ученые подтвердили экспериментально на бактериальном белке антибиотикорезистентности.

Белковая инженерия — раздел биотехнологии, который занимается поиском и созданием белков с улучшенными или совершенно новыми функциями. Один из основных экспериментальных методов белковой инженерии — направленная эволюция, при которой интересующий ученых белок проходит через несколько циклов мутагенеза и последующего отбора удачных вариантов. Хотя этот подход эффективен, он не позволяет проверить все возможные последовательности и требует значительных экспериментальных усилий.

Расширить область поиска новых белков и более детально понять взаимосвязь «последовательность — функция» помогают методы машинного обучения. В новом исследовании ученые из США использовали глубокое обучение, чтобы учесть эволюционный контекст при предсказании функции белка. Подробно о работе алгоритма ECNet (англ. evolutionary context-integrated neural network — нейронная сеть, интегрированная в эволюционный контекст) рассказано в статье, опубликованной в журнале Nature Communications.

Для предсказания функции ECNet использует информацию об аминокислотной последовательности известных «родственников» исследуемого белка — так алгоритм узнает, какие аминокислоты функционально связаны и важны для работы белка. Новый подход оказался точнее, чем другие существующие методы предсказания функции белка, основанные на машинном обучении.

Чтобы экспериментально подтвердить эффективность алгоритма, ECNet использовали для создания β-лактамазы ТЕМ-1 — фермента, придающего устойчивость к β-лактамным антибиотикам, — и выявления вариантов, которые повышали устойчивость к ампициллину.

Сейчас исследователи используют ECNet для разработки ферментов-катализаторов с улучшенной селективностью.

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl + Enter.

Читайте также:  Мэг Райан и Джон Мелленкамп по сообщениям воссоединились !
Загрузка...
Отзывы и комментарии к статье Глубокое обучение поможет создавать белки с новыми функциями

Оставить отзыв

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

*
*

8 − 5 =

Человек
Содержание«Морщины оставьте. Не нужно их скрывать. Я потратила всю свою жизнь на то, чтобы они у меня

Экстрасенсы
Экстрасенс Нгуен Чунг Дик, биография 21-летний черный маг. Украинец вьетнамского происхождения. Прошел

Перепела
Клетки для разведения перепелов Клетки для разведения перепелов можно приобрести на птичьих рынках,

Top